Бывший чиновник также должен будет возместить ущерб в размере 247,6 миллиона сомов (229,2 миллиона рублей).
Исакова удалили из зала суда в декабре 2019 года на весь период рассмотрения уголовного дела после того, как он заявил о применении силы со стороны следствия, а также выразил протест против президента Сооронбая Жээнбекова и его брата депутата Асылбека Жээнбекова. Его адвокаты заявили, что это нарушает право экс-чиновника на защиту в суде. Исаков не признает вину.
По делу о коррупции при реконструкции музея проходят шесть бывших чиновников: Исаков, бывшая завотделом религиозной и этнической политики аппарата президента
Мира Карыбаева, экс-замглавы Госстроя Алмаз Абдыкаров, бывший глава Департамента жилищно-гражданского строительства Шайбек Атамбеков, его заместитель Улугбек Матисаков и один из учредителей компании подрядчика ОсОО СМУ-3 Айдарбек Мендеев.
Исторический музей в Бишкеке закрыли на реконструкцию в марте 2016 года по инициативе бывшего президента Алмазбека Атамбаева. Исаков курировал реконструкцию. В мае 2018 года депутаты посетили реконструированный музей и заявили, что здание отремонтировали без тендера и проектно-сметной документации.
Генеральная прокуратура оценила ущерб в 101,6 миллиона сомов. Дело объединили с делом о коррупционных правонарушениях при строительстве ипподрома в городе Чолпон-Ате.
