По версии ФСБ, Филонов поручил изменить вид разрешенного использования около 14 га принадлежавших городу земель, чтобы их можно было сдавать в аренду по заниженной стоимости.
Дело возбудили по статье «Превышение должностных полномочий с причинением тяжких последствий» (ч. 3 ст. 286 УК РФ). Филонов заявил, что «будет защищаться» и сотрудничать со следствием.
За день до этого Филонова уволили по иску прокуратуры из-за назначения директором одного из муниципальных учреждений отца своей гражданской жены. Решение принял Евпаторийский городской суд, о нем Филонов написал у себя в фейсбуке. Он отметил, что «есть веские правовые основания считать, что судебное решение останется нереализованным и не вступит в силу».
В тот же день сообщалось об обысках и выемке документов в администрации и кабинете мэра.
В октябре 2018 года Филонов сообщал, что Специальная комиссия городского совета Евпатории рассматривала представление, внесенное местным прокурором, о его увольнении «в связи с коррупционными деяниями». Он пообещал подать в отставку, если комиссия обнаружит в назначении его зятя коррупционную составляющую. «Я, как мэр, подписываю документ, прошедший все согласования, в том числе на конфликт интересов, и антикоррупционную экспертизу», — сказал он.
Филонов был мэром Евпатории с ноября 2014 года. До этого он был советником главы Крыма по курортам и туризму.
